Tõhustatud koostöö menetlus kehtestati Amsterdami lepinguga ning võimaldab seda soovivatel liikmesriikidel teha üksteisega tihedamat koostööd.
Euroopa Liidu liikmesriigid võivad taotleda tõhustatud koostööd aluslepingutega hõlmatud valdkondades, välja arvatud liidu ainupädevusse kuuluvad valdkonnad. Komisjon hindab taotlust ja võib esitada nõukogule sellekohase ettepaneku. Kui komisjon otsustab ettepanekut mitte esitada, selgitab ta asjaomastele liikmesriikidele selle põhuseid.
Kui komisjon ettepaneku esitab, annab nõukogu pärast Euroopa Parlamendi nõusoleku saamist loa tõhustatud koostöö alustamiseks.
Ühise välis- ja julgeolekupoliitika raames toimuva tõhustatud koostöö korral saadetakse taotlus nõukogule ning edastatakse välisasjade ja julgeolekupoliitika kõrgele esindajale ja komisjonile arvamuse saamiseks. Taotlus edastatakse teavitamise eesmärgil ka parlamendile.
Kõigil juhtudel teavitatakse parlamenti korrapäraselt arengutest tõhustatud koostöö vallas.